Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNH4Q9UQ05 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNH4Q9UQ05 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms