Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAK1Q9UPV9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAK1Q9UPV9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms