Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SETD1BQ9UPS6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SETD1BQ9UPS6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms