Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFSF18Q9UNG2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms