Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHA12Q9UN75 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCDHA12Q9UN75 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms