Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNX12Q9UMY4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms