Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PADI1Q9ULC6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms