Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHIC2Q9UKJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms