Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RIMS3Q9UJD0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms