Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEFF2Q9UIK5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms