Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNA3Q9UI47 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms