Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO40Q9UH90 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO40Q9UH90 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms