Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLIP2Q9UDT6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms