Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
COPS7AQ9UBW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS7AQ9UBW8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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