Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL9Q9P2J3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms