Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRBP1Q9P2E9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRBP1Q9P2E9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms