Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL20A1Q9P218 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL20A1Q9P218 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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