Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHRF1Q9P1Y6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHRF1Q9P1Y6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms