Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CABP1Q9NZU7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms