Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDE1Q9NZC3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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