Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTEL1Q9NZ71 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTEL1Q9NZ71 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms