Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9orf78Q9NZ63 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf78Q9NZ63 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms