Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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FAM53CQ9NYF3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM53CQ9NYF3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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