Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLC39A9Q9NUM3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms