Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GINM1Q9NU53 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GINM1Q9NU53 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms