Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RRP7BPQ9NSQ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP7BPQ9NSQ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms