Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms