Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms