Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HELLSQ9NRZ9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HELLSQ9NRZ9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms