Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA4L2Q9NRX3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms