Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FBXO8Q9NRD0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FBXO8Q9NRD0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms