Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM10Q9NQV6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms