Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAF1DQ9H5J8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TAF1DQ9H5J8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms