Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
KCNQ1DNQ9H478 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms