Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF541Q9H0D2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF541Q9H0D2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms