Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTDSP1Q9GZU7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms