Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGAP39Q9C0H5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGAP39Q9C0H5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms