Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF3BQ9BZI7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF3BQ9BZI7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms