Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PUS3Q9BZE2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PUS3Q9BZE2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms