Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNHG12Q9BXW3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms