Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLVAPQ9BX97 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLVAPQ9BX97 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms