Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NUP58Q9BVL2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NUP58Q9BVL2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms