Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C9orf16Q9BUW7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C9orf16Q9BUW7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms