Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NDUFAF3Q9BU61 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFAF3Q9BU61 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms