Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RSG1Q9BU20 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RSG1Q9BU20 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms