Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UPK3BQ9BT76 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UPK3BQ9BT76 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UPK3BQ9BT76 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UPK3BQ9BT76 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UPK3BQ9BT76 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UPK3BQ9BT76 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UPK3BQ9BT76 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UPK3BQ9BT76 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UPK3BQ9BT76 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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