Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK1Q9BRS2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK1Q9BRS2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms