Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MESP1Q9BRJ9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MESP1Q9BRJ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms