Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms