Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOPXQ9BPY8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOPXQ9BPY8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms